發展重點
1.　宗族文化及其聚落研究
結合人類學與空間研究領域，以保存完整的宗族、宗祠及其聚落的金門為田野調查基地，長期進行深入的調查及研究，並可與其他華南地區或台灣、南洋華人宗族文化進行比較研究。另一方面，閩南語的研究、教學及比較研究，以及收集、數位典藏仍大量留存於金門民間的地方史料（族譜、地契等），亦為本所關注的學術課題。換言之，思考閩南文化相關事務的保存課題，研擬教育傳承及推廣之可行對策，為金門奠下閩南文化研究重鎮之基礎，是本所的發展重點。

2.　僑鄉研究
金門為閩粵著名僑鄉之一，自1840年代以後遠渡南洋者眾。昔日華僑研究偏重於僑居地華人社會的變遷，較少著墨於華僑、僑匯經濟或外洋文化帶給僑鄉社會的近代化歷程。僑鄉社會文化變遷，表現於實業發展、洋樓建築、華僑家庭結構、僑鄉婦女處境等向度。以金門僑鄉文化保存的豐富度，若能結合社會學、歷史學及文化研究等領域，可開拓全新的學術領域。

3.　戰地研究
在二十世紀中葉後，近半世紀以來金門作為世界冷戰、兩岸對峙的衝突點，傳統社會被高度動員及整編，地景則成為軍事防禦的設施。從傳統社會到戰地社會，從傳統聚落空間到戰地景觀，隨著檔案的解密與金門的去軍事化，實為重要的學術課題。本所成立之後，將積極進行近代戰事史的口述歷史（如古寧頭戰役、九三砲戰、八二三砲戰等）、戰地政務法制史、民間文化抵抗、軍事地景等研究主題。

4.　數位典藏技術應用
隨著數位保存技術的快速發展與潮流，所有的文化資產將進入數位化的領域，因此本學程致力於文化資產數位化保存典藏與展示應用技術的整合，著重於３Ｄ數位技術應用的研究，務必使本學程的學生均能具備３Ｄ數位技術之能力。